永昌元年己丑，公元689年春季，正月乙卯朔，太后在万象神宫举行盛大祭祀典礼。她身着帝王礼服礼帽，腰插大圭，手持镇圭，担任初献；皇帝担任亚献，太子担任终献。祭祀的顺序先是昊天上帝神座，接着是唐高祖、唐太宗、唐高宗，再是魏国先王，最后是五方天帝神座。祭祀完毕后，太后驾临则天门，大赦天下，更改年号。丁巳日，太后驾临明堂，接受文武百官的朝贺。戊午日，太后在明堂宣布政令，颁布九条训诫来约束百官。己未日，太后再次驾临明堂，设宴款待群臣。
二月丁酉日，太后追尊父亲魏忠孝王为周忠孝太皇，母亲为忠孝太后，将父亲在文水的陵墓命名为章德陵，在咸阳的陵墓命名为明义陵，同时设置崇先府负责相关事务。戊戌，太后又追尊鲁公为太原靖王，北平王为赵肃恭王，金城王为魏义康王，太原王为周安成王。
三月甲子日，张光辅暂代纳言一职。
壬申日，太后向正字陈子昂询问当前治理国家的关键要务。陈子昂退朝后，呈上奏疏，认为：“应当放宽刑罚、推崇德行，停止战事、减轻赋税徭役，安抚皇室宗亲，让他们各自安心度日。”奏疏言辞委婉恳切，论述精辟，篇幅将近三千字。
癸酉日，朝廷任命天官尚书武承嗣为纳言，张光辅暂代内史。
夏季，四月甲辰日，朝廷处死辰州别驾汝南王李炜、连州别驾鄱阳公李諲等十二名皇室成员，并将他们的家属流放到巂州。李炜是李恽的儿子，李諲是李元庆的儿子。
己酉日，朝廷处死天官侍郎蓝田人邓玄挺。邓玄挺的女儿是李諲的妻子，他本人又与李炜交好。李諲曾谋划从庐陵迎回唐中宗，还就此事询问过邓玄挺的意见；李炜也曾经对邓玄挺说：“打算采取紧急行动，你觉得怎么样？”邓玄挺都没有回应。最终他因犯了知情不报的罪，与李炜、李諲等人一同被处死。
五月丙辰日，朝廷任命文昌右相韦待价为安息道行军大总管，率军攻打吐蕃。浪穹州蛮族首领傍时昔等二十五部，原本归附吐蕃，到这时前来投降。朝廷任命傍时昔为浪穹州刺史，让他统领本部族的部众。
己巳日，朝廷任命僧人薛怀义为新平军大总管，率军北上征讨突厥。薛怀义率军行进到紫河一带，始终没有遭遇突厥军队，于是在单于台刻石记功，之后率军返回。
此前诸王起兵反叛时，唯有贝州刺史纪王李慎没有参与谋划，但还是受到牵连被关进监狱。秋季，七月丁巳日，李慎被用囚车押往巴州流放，还被改姓为虺氏，走到蒲州时便去世了。他的八个儿子，包括徐州刺史东平王李续等人，先后被处死，家属也被流放到岭南。
李慎的女儿东光县主李楚媛，自幼以孝顺恭谨闻名。她嫁给司议郎裴仲将后，夫妻二人相敬如宾；婆婆生病时，她亲自熬制药膳并亲口尝过再奉上；对待妯娌也十分友善，深得她们的欢心。当时皇室的女子大多崇尚骄奢，她们嘲笑李楚媛生活简朴，说：“富贵的可贵之处，在于能随心所欲、快意生活。如今你独自坚守勤俭吃苦，图的是什么呢？”李楚媛回答说：“我自幼喜爱礼仪，如今亲身践行礼仪，这难道不是随心所欲吗！纵观自古以来的女子，都以恭顺节俭为美德，以放纵奢侈为恶行。我只担心玷污家族的名声，哪里还有别的奢求呢？富贵本是偶然得来的东西，哪里值得向人炫耀！”众人听后都羞愧不已，对她心生敬佩。等到李慎的死讯传来，李楚媛悲痛大哭，甚至呕出几升血；守丧期满后，她将近二十年都不施粉黛、不做修饰。
韦待价的军队抵达寅识迦河后，与吐蕃军队交战，遭遇惨败。当时恰逢大雪，军粮运输中断。韦待价本就没有领兵作战的才能，此时更是手足无措、陷入困窘。士兵们又冷又饿，伤亡惨重，韦待价只好率领残军撤退。太后得知后勃然大怒，丙子日，下令削去韦待价的官籍，将他流放到绣州，同时处死副大总管安西大都护阎温古。安西副都护唐休璟收拢残余的士兵，安抚安西地区的百姓，太后于是任命唐休璟为西州都督。
戊寅日，朝廷任命王本立为同凤阁鸾台三品。
徐敬业兵败后，他的弟弟徐敬真被流放到绣州，后来趁机逃回，打算逃往突厥。途经洛阳时，洛州司马弓嗣业、洛阳令张嗣明资助他继续前行。徐敬真抵达定州时被官府抓获，弓嗣业畏罪上吊自尽。张嗣明和徐敬真为了保全性命，胡乱牵连天下的名士，谎称这些人都有谋反的意图。于是朝野上下有很多人因此被牵连处死。张嗣明还诬告内史张光辅，说他“征讨豫州的时候，私下议论图谶和天文，对朝廷怀有二心”。八月甲申日，张光辅与徐敬真、张嗣明等人一同被处死，家产也被官府查抄没收。
乙未日，秋官尚书太原人张楚金、陕州刺史郭正一、凤阁侍郎元万顷、洛阳令魏元忠，都被免去死罪，流放到岭南。他们都是被徐敬真牵连，被诬陷与徐敬业合谋反叛。临刑前，太后派凤阁舍人王隐客骑马赶来传旨赦免。赦免的消息传到刑场，即将受刑的人都欢呼雀跃，激动得辗转不已；只有魏元忠镇定自若地坐着不动。有人让他起身，他说：“消息是真是假还不确定。”王隐客赶到后，又让他起身，他又说：“等宣读完敕令再说。”等到敕令宣读完毕，他才缓缓起身，行舞蹈跪拜之礼谢恩，脸上始终没有流露出一丝喜忧的神色。当天原本阴云密布，笼罩四野，赦免张楚金等人之后，天气立刻转晴，天空放亮。
九月壬子日，朝廷再次任命僧人薛怀义为新平道行军大总管，率领二十万大军征讨突厥首领骨笃禄。
当初唐高宗在位时，周兴以河阳县令的身份被召见，高宗本想提拔任用他，有人上奏说他并非出身清贵的名门，此事便搁置了下来。周兴对此并不知情，多次到明堂等候任命。各位宰相都对他视而不见，当时担任地官尚书、检校纳言，同时兼任同平章事的魏玄同对他说：“周县令还是回去吧。”周兴误以为魏玄同从中作梗，阻碍自己的仕途，便对他怀恨在心。魏玄同向来与裴炎交情深厚，人们因为他们的情谊始终没有改变，称他们为“耐久的朋友”。周兴于是上奏诬告魏玄同，谎称他说过“太后年纪大了，不如辅佐继位的君主，这样才能长久安稳”。太后听后大怒，闰月甲午日，下令赐魏玄同在家自尽。监刑御史房济对魏玄同说：“您为何不主动告密，或许能借此获得召见，趁机为自己辩白！”魏玄同叹息道：“被人杀死和被鬼杀死，又有什么区别呢？我岂能去做告密这种事！”随后从容赴死。太后又派人在隐蔽的地方杀死夏官侍郎崔詧。除此之外，朝廷内外还有很多大臣被处死或流放。
彭州长史刘易从也被徐敬真牵连，戊申日，在彭州被处死。刘易从为人仁厚孝顺、忠诚谨慎，他在街市上将要受刑时，当地的官吏和百姓都怜悯他是无辜的，从四面八方赶来，纷纷脱下自己的衣服扔在地上，说：“愿用这些衣服为长史祈求阴间的福分。”官府清点这些衣服的价值，总共超过十万钱。
周兴等人诬告右武卫大将军燕公黑齿常之谋反，朝廷将他召回京城关进监狱。冬季，十月戊午日，黑齿常之在狱中上吊身亡。
己未日，朝廷处死宗室鄂州刺史嗣郑王李璥等六人。庚申日，嗣滕王李修琦等六人被免去死罪，流放到岭南。丁卯日，朝廷任命春官尚书范履冰、凤阁侍郎邢文伟同为同平章事。己卯日，太后下诏，规定太穆神皇后、文德圣皇后应当配享皇地只的祭祀，忠孝太后陪同配享。
右卫胄曹参军陈子昂呈上奏疏，认为：“周朝称颂周成王、周康王，汉朝称颂汉文帝、汉景帝，都是因为他们能够搁置刑罚、以德治国的缘故。如今陛下的治理虽然已经十分完善，但太平盛世的朝堂上下，百姓都乐于接受教化，不应该总有乱臣贼子每天触犯国法、遭受上天的诛杀。近来大案要案不断增多，被指控为叛逆的人越来越多。我愚昧迟钝，起初以为这些人都罪有应得，直到上月十五日，陛下特地查清囚犯李珍等人无罪并赦免了他们，文武百官都为之庆贺喜悦，纷纷称颂陛下圣明，我才知道原来也有无辜之人落入宽大的法网中。陛下一心致力于推行宽和的法令，而狱官却急于施行严酷的刑罚，这既损害了陛下的仁德，也玷污了太平盛世的清明政治，我私下里对此深感痛惜。另外，陛下颁布敕令赦免张楚金等人死罪的时候，起初风雨交加，随后便转为吉祥的祥云。我听说，阴气凝重代表刑罚严苛，阳气舒朗代表君主德政；圣明的君主效法上天行事，上天也会辅佐圣明的君主。天意既然如此，陛下怎能不顺应天意呢！如今又出现阴雨天气，我担心过错出在狱官身上。凡是被关押在监狱里的囚犯，大多被判处了死刑，民间百姓对此议论纷纷，意见不一。陛下为何不召见所有囚犯，亲自审问他们的罪名？确实有罪的，就公开依法惩处；被冤枉的，就严厉惩治相关狱官，让天下人都心悦诚服，人人都知晓朝廷的政令和刑罚，这难道不是陛下至高无上的德行彰显于世的体现吗！”
天授元年，公元690年，十一月庚辰朔日，冬至。太后在万象神宫举行祭祀大典，大赦天下。朝廷开始采用周历，将永昌元年十一月改为载初元年正月，把十二月定为腊月，夏历正月改为一月。朝廷将周朝、汉朝的后裔封为“二王后”，将舜、禹、成汤的后裔封为“三恪”，北周、隋朝的后裔则享受与列国诸侯同等的待遇。
凤阁侍郎河东人宗秦客，改造了“天”“地”等十二个字进献给太后。丁亥日，这些新字正式推行。太后为自己取名为“武曌”，同时将皇帝的“诏”书改为“制”书。宗秦客是太后堂姐的儿子。乙未日，司刑少卿周兴上奏，请求废除李唐皇室成员的宗族名籍。腊月辛未日，朝廷任命僧人薛怀义为右卫大将军，赐封爵位为鄂国公。
春季一月戊子日，武承嗣升任文昌左相，岑长倩升任文昌右相、同凤阁鸾台三品，凤阁侍郎武攸宁被任命为纳言，邢文伟暂代内史一职，左肃政大夫、同凤阁鸾台三品王本立被罢免，改任地官尚书。武攸宁是武士彟哥哥的孙子。
当时武承嗣、武三思专权用事，宰相们都对他们阿谀奉承。地官尚书、同凤阁鸾台三品韦方质身患重病，武承嗣、武三思前去探望，韦方质靠着床榻，没有对他们行拜见之礼。有人劝说他要懂得变通，韦方质回答：“生死自有天命，大丈夫怎能屈身侍奉皇亲国戚，来换取苟且偷生的机会呢！”不久后，韦方质就被周兴等人诬陷构罪。甲午日，他被流放到儋州，家产也被官府查抄没收。
二月辛酉日，太后在洛城殿亲自策问前来应试的贡士。科举考试中的殿试制度，从此开始实行。丁卯日，地官尚书王本立去世。
三月丁亥日，特进、同凤阁鸾台三品苏良嗣去世。
夏季四月丁巳日，春官尚书、同平章事范履冰，因曾举荐过谋反之人获罪，被关进监狱处死。
醴泉人侯思止，起初以卖饼为生，后来投靠游击将军高元礼做了仆人，向来为人狡诈无赖。恒州刺史裴贞鞭打了一名判官，这名判官就唆使侯思止诬告裴贞与舒王李元名谋反。秋季七月辛巳日，李元名因此被废黜王位，流放到和州；壬午日，朝廷处死了他的儿子豫章王李亶，裴贞也被灭族。侯思止则被提拔为游击将军。当时告密的人往往能被授予五品官职，侯思止请求担任御史，太后说：“你不识字，怎么能胜任御史的职位呢！”侯思止回答：“传说中的獬豸何曾识过字？它却能辨别奸邪之人。”太后听后十分高兴，当即任命他为朝散大夫、侍御史。后来有一天，太后打算把先前查抄来的宅邸赏赐给他，侯思止却拒不接受，说：“我厌恶谋反叛逆之人，不愿住进他们的房子里。”太后因此更加赏识他。
衡水人王弘义，向来品行不端。他曾经向邻居讨要瓜，邻居没有给他，他就诬告邻居家的瓜田里有白兔。官府派人到瓜田里搜查捕捉，结果把整片瓜田践踏得一干二净。他又在赵州、贝州一带游荡，看到乡里的老人聚集在一起举行祭祀活动，就诬告他们谋反，导致二百多人被处死。王弘义也因此被提拔为游击将军，不久后又升任殿中侍御史。有人诬告胜州都督王安仁谋反，太后下令让王弘义审理此案。王安仁拒不认罪，王弘义当即就在他的枷锁上砍下了他的头颅；随后王安仁的儿子恰好赶到，王弘义又将他斩首，把父子二人的头颅装进匣子带回京城。途经汾州时，汾州司马毛公陪他一同吃饭，片刻之后，王弘义突然呵斥毛公走下台阶，将他斩首，并用长枪挑着毛公的头颅返回洛阳，见到这一幕的人无不心惊胆战。当时朝廷在丽景门内设置了专门的监狱，被关进这座监狱的人，没有能活着出来的，王弘义戏谑地将其称为“例竟门”。朝中官员人人自危，见面时不敢交谈，只能用眼神示意。有人甚至在上朝时被突然逮捕，因此官员们每次上朝，都要和家人诀别说：“不知道还能不能再相见？”
当时的法官们争相施行严酷的刑罚，只有司刑丞徐有功、杜景俭秉持公正宽宥的原则。被诬告的人都说：“遇到来俊臣、侯思止，必定会死；遇到徐有功、杜景俭，就一定能活下来。”
徐有功是徐文远的孙子，原名徐弘敏，世人通常称呼他的字。他起初担任蒲州司法，治理政务以宽厚为原则，从不使用刑具。下属们相互约定，若有人触犯法规，致使徐有功动用杖刑，众人就一起斥责此人。直到徐有功任期满，他没有杖责过一个人，政务却处理得十分妥当。他多次升迁后担任司刑丞，被酷吏诬陷构罪的人，都经他审理得以平反，前前后后总共救活了几十上百家。徐有功曾经在朝堂上为案件争辩，太后怒容满面地斥责他，身边的人都吓得瑟瑟发抖，徐有功却神色坚定，争辩得更加恳切。太后虽然生性好杀，但知道徐有功为人正直，对他既敬重又忌惮。杜景俭是武邑人。
司刑丞荥阳人李日知也崇尚公正宽宥。少卿胡元礼想要处死一名囚犯，李日知认为不可以，两人为此争执了好几天。胡元礼愤怒地说：“只要我还在刑曹任职，这个囚犯就绝没有活下去的可能！”李日知回应：“只要我还在刑曹任职，这个囚犯就绝不会被判处死刑！”最终两人各自将自己的意见上奏，李日知的主张果然被采纳。东魏国寺僧人法明等人撰写了四卷《大云经》，并上奏朝廷，声称太后是弥勒佛下凡，应当取代唐朝，成为人世间的君主。太后下令将这部经书颁行全国。
武承嗣指使周兴罗织罪名，诬告隋州刺史泽王李上金、舒州刺史许王李素节谋反，下令征召他们前往太后所在的都城。李素节从舒州出发时，听到有人因丧事哭泣，叹息道：“能病死该是多么幸运的事啊，还有什么值得哭泣的呢！”丁亥日，李素节走到龙门时，被人缢杀。李上金得知后，选择了自尽。他们的儿子以及亲属党羽，全部被处死。
太后打算将太平公主嫁给自己伯父武士让的孙子武攸暨。当时武攸暨担任右卫中郎将，太后暗中派人杀死了他的妻子，然后将太平公主嫁给了他。太平公主额头宽阔、脸颊丰满，富有谋略，太后认为她和自己很像，因此对她格外宠爱，常常和她秘密商议天下大事。按照旧制，诸王的食邑不超过一千户，公主的食邑不超过三百五十户；唯独太平公主的食邑被屡次增加，达到了三千户。
八月甲寅日，朝廷处死太子少保、纳言裴居道；癸亥日，处死尚书左丞张行廉。辛未日，处死南安王李颍等十二名皇室成员，又将已故太子李贤的两个儿子鞭打死。至此，李唐皇室几乎被屠戮殆尽，那些幸存的年幼体弱之人，也都被流放到岭南，他们的亲族党羽几百家也被一并诛杀。只有千金长公主凭借谄媚讨好得以保全性命，她主动请求认太后为母亲，并且改姓武氏；太后十分喜爱她，将她改封为延安大长公主。
九月丙子日，侍御史汲县人傅游艺率领九百多名关中百姓前往朝堂上奏，请求将国号改为周，赐皇帝姓武氏。太后没有同意，但提拔傅游艺为给事中。此后，文武百官、皇室宗亲、各地百姓、四方少数民族的酋长、僧人、道士等共六万多人，都纷纷上奏提出与傅游艺相同的请求，皇帝也主动上书，请求太后赐自己姓武氏。戊寅日，群臣上奏说：“有凤凰从明堂飞到上阳宫，又飞回停落在左台的梧桐树上，过了很久，才向东南方向飞去；还有几万只赤雀聚集在朝堂之上。”
庚辰日，太后批准了皇帝和群臣的请求。壬午日，太后驾临则天门，大赦天下，将唐朝改为周朝，更改年号。乙酉日，太后加尊号为圣神皇帝，将皇帝立为皇嗣，赐姓武氏；将皇太子改立为皇孙。
丙戌日，太后在神都洛阳建立武氏七庙，追尊周文王为始祖文皇帝，周文王的妻子姒氏为文定皇后；追尊周平王的小儿子姬武为睿祖康皇帝，姬武的妻子姜氏为康惠皇后；追尊太原靖王为严祖成皇帝，其妻子为成庄皇后；追尊赵肃恭王为肃祖章敬皇帝，魏义康王为烈祖昭安皇帝，周安成王为显祖文穆皇帝，忠孝太皇为太祖孝明高皇帝。这些人的妻子都按照其丈夫的谥号，追封为皇后。太后立武承嗣为魏王，武三思为梁王，武攸宁为建昌王；武士彟哥哥的孙子武攸归、武重规、武载德、武攸暨、武懿宗、武嗣宗、武攸宜、武攸望、武攸绪、武攸止，都被封为郡王；武氏的各位姑母、姐妹，都被封为长公主。
朝廷又任命司宾卿溧阳人史务滋为纳言，凤阁侍郎宗秦客为检校内史，给事中傅游艺为鸾台侍郎、平章事。傅游艺与岑长倩、右玉钤卫大将军张虔勖、左金吾大将军丘神积、侍御史来子珣等人，都被赐姓武氏。宗秦客曾暗中劝说太后改朝换代，因此最先被任命为内史。傅游艺在一年之内，接连穿戴上青、绿、朱、紫四种不同颜色的官服，当时的人称他为“四时仕宦”。
太后下令将各州改为郡。有人对太后说：“陛下刚刚改朝换代就废除州制，这是不吉利的。”太后于是立刻下令追回诏令。太后任命史务滋等十人担任安抚使，巡视安抚各道。癸卯日，太后将兄长的孙子武延基等六人封为郡王。
冬季，十月甲子日，检校内史宗秦客因贪赃获罪，被贬为遵化县尉；他的弟弟宗楚客、宗晋卿也因犯有贪赃枉法之罪，被流放到岭南。丁卯日，朝廷处死被流放的韦方质。
辛未日，内史邢文伟因依附宗秦客获罪，被贬为珍州刺史。不久之后，有朝廷的使者抵达珍州，邢文伟以为是来诛杀自己的，便急忙上吊自尽了。
壬申日，太后下令让两京以及各州都修建一座大云寺，用来收藏《大云经》，并让僧人登上法座讲解这部经书。参与撰写《大云经》注疏的僧人云宣等九人，都被赐封爵位为县公，还被赏赐紫色袈裟、银龟袋。
太后下令，天下所有武氏族人都免除赋税徭役。
西突厥的十姓部落，自从垂拱年间以来，一直遭受东突厥的侵扰掳掠，部众几乎逃散殆尽。蒙池都护继往绝可汗斛瑟罗收拢残余部众六七万人，迁入内地居住，朝廷任命他为左卫大将军，改封号为竭忠事主可汗。
道州刺史李行褒兄弟被酷吏诬陷，判处灭族之罪。秋官郎中徐有功坚持为他们争辩，却没能成功。秋官侍郎周兴上奏说徐有功故意为谋反的囚犯开脱罪责，应当斩首。太后虽然没有批准处死徐有功，但还是罢免了他的官职。不过太后向来器重徐有功，过了一段时间，又重新起用他为侍御史。徐有功趴在地上，流着泪坚决推辞说：“我听说鹿在山林中奔跑，性命却掌握在厨师手中，这是形势使然。陛下任命我为法官，我不敢违背陛下的法令，必定会死在这个职位上。”太后坚持要授予他官职，远近之人听到这个消息后，都相互庆贺。
这一年，朝廷任命右卫大将军泉献诚为左卫大将军。太后拿出金银珠宝，下令挑选南北衙禁军里擅长射箭的五个人比试射箭技艺，泉献诚的成绩位列第一。他却将第一让给了右玉钤卫大将军薛咄摩，薛咄摩又把第一让回给泉献诚。泉献诚于是上奏说：“陛下下令挑选擅长射箭的人，如今入选的大多不是汉族官员，我私下担心四方少数民族会因此轻视汉人，请求停止这场射箭比试。”太后认为他说得很对，就采纳了他的建议。
天授二年，公元691年，正月癸酉朔日，太后首次在万象神宫接受尊号，朝廷的旗帜崇尚赤色。甲戌日，太后下令在神都洛阳重新设置社稷坛。辛巳日，太后将武氏的神主牌位送入太庙；将长安的李唐太庙改名为享德庙，一年四季只祭祀唐高祖及以下的三位皇帝，其余四座祭室则关闭，不再进行祭祀。太后又将长安的崇先庙改名为崇尊庙。乙酉日，冬至，太后在明堂举行盛大祭祀典礼，祭祀昊天上帝，各路神灵一同配享祭祀，武氏的祖宗也一同配享，李唐的三位皇帝也一起配享。
御史中丞、代理御史大夫李嗣真因为酷吏横行无忌，上疏说：“如今告发的事情纷繁杂乱，虚假的多，真实的少，恐怕有奸邪之徒阴谋离间陛下与群臣的关系。古代案件审理完毕后，公卿大臣会共同参与审核，君王也会多次宽宥，之后才执行刑罚。近来负责审案的官员，独自乘车奉命出使，审讯定案之后，执法部门就依照其判决执行，不再下令重新审理；有的官员甚至当场擅自作出判决，不再上奏陛下知晓。如此一来，大权就落入臣子手中，这不是周密审慎的做法。倘若存在冤屈错判的情况，陛下又怎么能够知道呢！况且让九品小官独自负责审讯复核案件，掌握生杀大权，窃取君主的威严。案件的复核既不经过秋官，审核复查又不通过门下省，国家的重要权力，轻易地交给他人，恐怕会成为国家的祸患。”太后没有听取他的意见。
饶阳县县尉姚贞亮等几百人上奏，请求为太后上尊号为上圣大神皇帝，太后没有同意。
侍御史来子珣诬告尚衣奉御刘行感兄弟谋反，刘行感兄弟都因此被处死。春季一月，地官尚书武思文和各地前来朝见的使者共二千八百人，上奏请求太后到中岳嵩山举行封禅大典。
己亥日，朝廷废除唐朝兴宁陵、永康陵、隐陵的署官，只酌情设置守陵民户。左金吾大将军丘神积因罪被处死。
纳言史务滋与来俊臣一同审理刘行感的案件，来俊臣上奏说史务滋与刘行感关系密切，有意隐瞒他谋反的实情。太后下令让来俊臣一并审理史务滋。庚子日，史务滋因恐惧而自杀。
有人告发文昌右丞周兴与丘神积串通谋反，太后下令让来俊臣审理此案。来俊臣与周兴正一同办理案件、相对吃饭，来俊臣对周兴说：“囚犯大多不肯认罪，应当用什么办法让他们招供呢？”周兴说：“这很容易。取一口大瓮，用炭火在四周烘烤，然后把囚犯放进瓮里，还有什么事情是他不肯承认的！”来俊臣于是命人找来一口大瓮，按照周兴说的方法，用炭火将其围起来烘烤，随后站起身对周兴说：“宫里有诏书命令我审讯你，请兄长进入这口大瓮吧。”周兴十分惶恐，连忙磕头认罪。按照律法，周兴应当被判处死刑，太后赦免了他的死罪。二月，周兴被流放到岭南，在途中被仇家杀死。
周兴与索元礼、来俊臣争相施行暴虐苛刻的手段，周兴、索元礼各自杀死了几千人，来俊臣则摧毁了一千多家。索元礼的手段尤为残酷，太后也将他处死，以此来安抚民心。朝廷将左卫大将军千乘王武攸暨改封为定王。太后立已故太子李贤的儿子李光顺为义丰王。
甲子日，太后下令将始祖的陵墓命名为德陵，睿祖的陵墓命名为乔陵，严祖的陵墓命名为节陵，肃祖的陵墓命名为简陵，烈祖的陵墓命名为靖陵，显祖的陵墓命名为永陵；将章德陵改名为昊陵，显义陵改名为顺陵。太后为李君羡追复官爵。
夏季四月壬寅朔日，出现日食。癸卯日，太后下令，认为佛教是开创改朝换代大业的开端，将其地位提升到道教之上。太后任命建安王武攸宜留守长安。丙辰日，朝廷铸造一口大钟，放置在皇宫的北门外。
五月，朝廷任命岑长倩为武威道行军大总管，率军攻打吐蕃。军队行进到半路时，岑长倩被太后召回，军队最终没有出征。
六月，朝廷任命左肃政大夫格辅元为地官尚书，与鸾台侍郎乐思晦、凤阁侍郎任知古一同担任同平章事。乐思晦是乐彦玮的儿子。
秋季七月，朝廷迁徙关内地区几十万民户，充实洛阳的人口。八月戊申日，纳言武攸宁被罢免，改任左羽林大将军；夏官尚书欧阳通被任命为司礼卿，兼管纳言事务。庚申日，朝廷处死玉钤卫大将军张虔勖。来俊臣审理张虔勖的案件时，张虔勖向徐有功申诉冤情。来俊臣大怒，命令卫士用乱刀将张虔勖砍死，并将他的头颅悬挂在街市上示众。
义丰王李光顺、嗣雍王李守礼、永安王李守义、长信县主等人，都被赐姓武氏，他们与唐睿宗的几个儿子都被幽禁在宫中，长达十多年不能迈出宫门。李守礼、李守义是李光顺的弟弟。有人告发地官尚书武思文当初曾与徐敬业串通谋反。甲子日，武思文被流放到岭南，恢复原来的徐姓。
九月乙亥日，朝廷处死岐州刺史云弘嗣。来俊臣审理此案时，没有审问任何一项罪名，就先砍下了云弘嗣的头颅，然后才伪造案卷上奏。他处死张虔勖时，也是用的这种手段。太后的敕令都予以批准，天下人都闭口不敢说话。
鸾台侍郎、同平章事傅游艺梦见自己登上了湛露殿，便把这件事告诉了亲近的人，此人将此事告发。壬辰日，傅游艺被关进监狱，自杀身亡。癸巳日，朝廷任命左羽林卫大将军建昌王武攸宁为纳言，洛州司马狄仁杰为地官侍郎，与冬官侍郎裴行本一同担任同平章事。太后对狄仁杰说：“你在汝南任职时，政绩十分出色。你想知道当初诬陷你的人的名字吗？”狄仁杰辞谢说：“陛下如果认为我有过错，我请求改正；如果知道我没有过错，那是我的幸运，我不愿意知道诬陷我的人的名字。”太后听后，深深赞叹并赏识他的胸襟。
在此之前，凤阁舍人修武人张嘉福指使洛阳人王庆之等几百人上奏，请求立武承嗣为皇太子。文昌右相、同凤阁鸾台三品岑长倩认为皇嗣已经在东宫，不应该再有这样的提议，于是上奏请求严厉斥责上书的人，并下令让他们散去。太后又询问地官尚书、同平章事格辅元的意见，格辅元坚决认为不可以立武承嗣为皇太子。因此，岑长倩、格辅元都大大违背了武氏族人的意愿。武氏族人于是排挤岑长倩，下令让他率军西征吐蕃。岑长倩还没有抵达前线，就被太后召回，关进了特制的监狱。武承嗣又诬陷格辅元。来俊臣又胁迫岑长倩的儿子岑灵原，让他牵连司礼卿兼管纳言事务的欧阳通等几十人，声称他们都参与了谋反。欧阳通被来俊臣审讯时，各种酷刑都用尽了，但他始终没有说一句认罪的话。来俊臣于是伪造了欧阳通的供词。冬季十月己酉日，岑长倩、格辅元、欧阳通等人都被处死。
王庆之拜见太后，太后说：“皇嗣是我的儿子，为什么要废掉他呢？”王庆之回答：“‘神灵不享用异族的祭品，百姓不祭祀外族的祖先。’如今是谁拥有天下，却要让李氏子孙继承皇位呢！”太后开导并打发他离开。王庆之趴在地上，以死相求，哭泣着不肯离去。太后于是拿出盖有官印的纸条给他，说：“你以后想见我，就拿这张纸条给守门的人看。”从此以后，王庆之屡次请求拜见太后，太后渐渐对他感到恼怒，下令让凤阁侍郎李昭德赐王庆之杖刑。李昭德将王庆之带到光政门外，对朝中官员说：“这个奸贼想要废掉我们的皇嗣，立武承嗣为太子！”随后下令用棍棒打他，打得他耳朵眼睛都流出血来，之后又用杖刑将他打死，王庆之的党羽这才散去。
李昭德于是趁机对太后说：“天皇是陛下的丈夫，皇嗣是陛下的儿子。陛下坐拥天下，应当将皇位传给子孙，让它成为千秋万代的基业，怎么能将皇位传给侄子呢！自古以来，从未听说过侄子做了天子，还会为姑姑立庙祭祀的！况且陛下是接受天皇的临终嘱托才执掌朝政的，如果将天下交给武承嗣，那么天皇就无法再享受子孙的祭祀了。”太后也认为他说得很有道理。李昭德是李乾佑的儿子。
壬辰日，朝廷处死鸾台侍郎、同平章事乐思晦和右卫将军李安静。李安静是李纲的孙子。太后将要改朝换代时，王公百官都上奏劝进，只有李安静神色严肃地加以拒绝。等到李安静被关进特制的监狱后，来俊臣审问他谋反的罪状，李安静说：“我是大唐的老臣，要杀就杀！至于说我谋反，实在是没什么可回答的！”来俊臣最终还是将他处死了。
太学生王循之上书，请求请假回乡，太后批准了他的请求。狄仁杰说：“我听说君主只有生杀大权不能交给别人，其余的权力都应该交给相关的职能部门。所以左、右丞这类官员，只负责审理徒刑以下的案件；左、右相这类官员，才负责审理流放以上的案件，这是因为官职越高，权力就越大。那太学生请假，本是丞、簿这类小官负责的事务，如果天子为此专门颁布敕令，那么天下的事情，难道都要靠天子颁布敕令来处理吗！如果一定要满足太学生的愿望，我请求陛下为这类事情制定一个通用的制度就可以了。”太后认为他说得很对。